首个长豇豆接近完整的基因组组装完成
我要评论8月9日，广东省农业科学院蔬菜研究所（以下简称“蔬菜所”）在植物科学著名期刊《Plant Biotechnology Journal》（中科院大类一区，豆接IF = 13.8）上发表题为“A near-complete assembly of asparagus bean provides insights into anthocyanin accumulation in pods”的近完基因研究论文，完成了长豇豆接近完整的整的组组装完基因组组装，并率先克隆了豇豆荚花青素合成的长豇成关键基因。蔬菜所叶菜豆类资源与育种团队博士杨易和中山大学博士吴志坤为论文的豆接共同第一作者，蔬菜所副研究员张艳为该论文的近完基因通讯作者。浙江省农业科学院研究员李国景、整的组组装完副研究员吴新义参与了该项工作。长豇成蔬菜所为第一署名单位，豆接中山大学和浙江省农科院为共同合作单位。近完基因
长豇豆(Vigna unguiculata ssp. sesquipedialis)是整的组组装完一种重要豆类蔬菜，被誉为亚洲十大栽培蔬菜之一，长豇成中国是豆接世界上长豇豆最大的种植和消费国。目前现有长豇豆基因组仍存在一定数量的近完基因间隙和未定位序列，这给功能基因组学研究带来挑战。作为果菜类蔬菜，外观和营养是重要的品质性状，花青素赋予植物绚丽色彩的同时亦有保健功效，然而，调控豇豆荚花青素积累的关键基因仍然未知。
据了解，本研究综合利用多种平台的测序数据，组装完成了长豇豆丰产6号接近完整的基因组，解锁了豇豆基因组中结构最为复杂的着丝粒区域、端粒区域及大片段重复序列等，这是目前最完整的豇豆基因组。同时综合利用该基因组和大规模转录组数据，成功鉴定出一个控制长豇豆豆荚色泽的关键转录因子基因VuMYB114，并进行功能验证。相关发现为阐明长豇豆花青素代谢途径的精细调控机制，以及未来设计育种提高豆荚的外观及营养价值奠定了基础。该成果是豇豆基因组学研究的重大突破，为豇豆研究领域提供了新的有力工具和重要理论基础。
该研究得到了广东省自然科学基金、广东省重点领域研发计划项目和广东省农业科学院创新基金等项目的资助。
【来源】广东省农业科学院蔬菜研究所
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